Le microbiote intestinal humain
Résumé
Le microbiote intestinal constitue un écosystème complexe dont l'impact sur la santé de l'Homme est aujourd'hui reconnu. Le tube digestif héberge des êtres unicellulaires comme des bactéries mais aussi des virus, des champignons et des archaea. Parmi tous ces micro-organismes, les bactéries forment le groupe le plus représenté. On considèrera donc que les données se référant au microbiote intestinal concernent les bactéries qui colonisent notre tube digestif.
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Le microbiote intestinal constitue un écosystème complexe dont l'impact sur la santé de l'Homme est aujourd'hui reconnu. Le tube digestif héberge des êtres unicellulaires comme des bactéries mais aussi des virus, des champignons et des archaea. Parmi tous ces micro-organismes, les bactéries forment le groupe le plus représenté. On considèrera donc que les données se référant au microbiote intestinal concernent les bactéries qui colonisent notre tube digestif.
Biodiversité, mise en place, stabilité et résilience
Le microbiote intestinal est composé de 1013 bactéries[1] réparties en 160 espèces bactériennes chez un individu parmi le millier d'espèces identifiées dans les cohortes humaines étudiées. Elles sont majoritairement distribuées en 4 phyla bactériens: Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, et Proteobacteria[2]. Vivant dans la plupart des cas en absence d'oxygène, dans un environnement dont les propriétés physico-chimiques sont souvent difficiles à caractériser et à reproduire, ces bactéries intestinales ne peuvent pas être cultivées en laboratoire.
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