Microbiote Intestinal. Un véritable nouvel organe

Résumé
La flore ou microbiote intestinal est l'ensemble des microorganismes (principalement des bactéries) qui colonisent notre tube digestif. Un être humain héberge 1014 bactéries dans son tractus digestif soit dix fois plus que de cellules eucaryotes. Le microbiote est adapté àson environnement et il existe une relation étroite de mutualisme entre microbiote et hôte. Plus de 70% des bactéries qui composent le microbiote intestinal ne sont pas cultivables par les méthodes classiques. Ces dernières années, l'avènement de la biologie moléculaire a permis l'analyse plus complète du microbiote intestinal et la description de sa grande diversité, en s'affranchissant des limites de la culture. Le microbiote intestinal représente une biomasse importante possédant de grandes capacités fonctionnelles dont l'hôte bénéficie largement, le faisant considérer par certains comme un « organe caché ».
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Introduction Le tube digestif héberge de nombreux micro-organismes, majoritairement des bactéries, qui constituent le microbiote intestinal ou microflore. Cette entité est connue depuis de nombreuses années par la communauté médicale et notamment les spécialistes d'organe dévolus à l'hépato-gastro-entérologie. Néanmoins, les difficultés techniques pour l'étude de cette entité ont pendant longtemps restreint la connaissance complète du microbiote intestinal tant dans sa description que dans ses fonctions physiologiques. L'avènement d'outils nouveaux, essentiellement issus de la biologie moléculaire ainsi que le développement de modèles animaux, ont permis l'ouverture de cette boîte noire. On assiste ainsi aujourd'hui à la véritable découverte d'un monde bactérien jusque-là inconnu. Ce monde vivant s'intègre dans un écosystème digestif extrêmement complexe, caractérisé par une extraordinaire biodiversité, et responsable de fonctions physiologiques majeures. Ceci fait de ce microbiote intestinal un véritable nouvel organe.
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