Contrairement aux spécialités d'organe, l'infectiolgie n'est pas facile à cerner. En médecine de ville ou à l'hôpital, de nombreux médecins font des diagnostics d'infections, prescrivent des antibiotiques et donc font de l'infectiolgie "générale" ou liée à l'organe concerné par leur spécialité. Les microbiologistes et les collègues de santé publique impliqués dans le diagnostic, la surveillance et la prise en charge d'épidémies participent naturellement à l'infectiolgie. Le métier d'infectiologue a donc été récemment redéfini par le Collège des Universitaires de Maladies Infectieuses et Tropicales (CMIT) et la sous-section 45-3 du CNU autour de deux activités principales : la pratique clinique et la référence en infectiologieantibiologie ("référentiel métier et compétences en infectiologie" disponible sur le site : infectiologie.com).